酒厂里的窖池实际上可以看作是一个大的反应器。它既是微生物的生长地，又是各种物质的化学反应器。在这个容器中进行着异常复杂的各式各样的反应，生成各种各样的物质。可以说，窖池就是一个微生物世界；同一个车间的相邻两个窖池的发酵生产过程，前一次发酵生产过程和后一次发酵生产过程，都是两个不同的过程。反映在产品质量和风格上，它们的一致性、稳定性是有限的。

窖池的窖壁和窖底是以泥为基础的，窖泥微生物固定繁殖在窖泥中，窖池的窖泥表面与里层微生物形成梯度分布状态，表层微生物多于里层微生物，而且厌氧芽孢菌、兼性菌分布都不相同，因此，越老的窖池窖泥越好，生产的优质酒越多。俗话说，老窖出好酒，这也是有一定道理的。窖池的上、中、下部微生物分布也有区别。特别是甲烷菌、乙酸菌、丁酸菌、丙酸菌、厌氧细菌、混合酸发酵菌、酵母菌、乳酸菌等这些复杂的微生物体系，在生长过程中有上千种酶进行着上千种生物化学反应，所以，其代谢产物异常复杂且极微量。

与窖池中窖泥接触部分的糟醅，蒸出的酒质量优于其余部分酒醅发酵产的酒，其原因就是微量成分种类多，含量高，黄水浸泡的酒醅同样因窖泥微生物的生长代谢，酒醅中香气成分种类多，酒质高于上层酒醅发酵产出的酒。

老窖池发酵蒸出的酒优于新窖池发酵蒸出的酒，主要表现为窖香浓郁、突出，而且己酸乙酯含量高，与其他的酯比例协调。虽然己酸乙酯是浓香型酒的主体香，但己酸乙酯不等于窖香，单独存在的己酸乙酯只是一种酯香，而不是窖香。但窖香也不是窖泥的味道，老窖泥有一定的香味，多了则是一种窖泥味或窖泥臭，新窖泥完全是窖泥臭。因此，在发酵的过程中，糟醅应该尽可能与窖泥接触，蒸酒时又要尽量避免带入窖泥和窖皮泥，以免给酒带入窖泥味或泥腥味。

窖香是窖泥微生物产生的复杂的代谢产物，经蒸馏过程提取浓缩带入浓香型酒中，并为其所特有的呈香呈味物质的综合表现。色谱骨架成分中的酸、酯、醇、醛等是其主要物质基础，特别是主体香己酸乙酯不可缺少。但除色谱能测定的骨架成分外，还有些复杂的微量成分仍是构成窖香的必不可少的重要物质，这些物质共同作用而产生窖香。